微生物發酵即利用微生物在一定的條件下，將原料經過特定的代謝途徑轉化為目標產物過程。一般需要的目標產物都是小分子物質，而微生物代謝過程還將產生大量的殘渣、雜蛋白、菌絲體等不溶性及可溶性雜質，為分離出目標產物，則需要采用一定的分離純化技術及設備進行處理。
由于微生物發酵工藝、產能的不同其分離純化設備的選擇也不同，如某微生物發酵液的目標產物分子量在2000-3000Da、含量只占1%，而發酵液量每批次為200kg，其中不溶性的固渣含量為10%，可溶性的大分子雜質含量為2%，針對這樣的物料情況，其的工藝方案為：
步采用60-80kg/h的離心先除不溶性的固渣，得到180kg離心液；
第二步：采用高分子膜對離心液進行過濾精制，除去2%的膠體、雜蛋白、菌體殘渣、懸浮物等雜質，約后期加溶劑置換頂洗，保證收率，約得到180kg含目標產物的精制液；
第三步：采用高抗膜對180kg精制液進行富集濃縮，約可濃縮10-12倍，即脫出160-165kg水分，得到純度較高的目標產物濃縮液15-20kg，再進行后續工藝。
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