投標保函辦理手續費（銀行保函）得根據辦理方式來定，如果企業自己去銀行辦理，交全額保證金，然后按照季度交手續費，大概在幾百塊不等，還有一種方式是通過占用第三方擔保公司在銀行的額度出的保函（分離式保函），這種保函跟企業自己去出保函效果一樣，出的保函上不體現擔保公司，只體現受益人、申請企業、項目名稱、保函金額和期限等信息，這種費用也是幾百塊，但是不用交保證金。
一、企業自己去銀行開。
（1）尤其次去，需要準備很多資料：經申請人簽章的《出具保函申請書》（建設銀行格式），包括標書、合同、有關部門批準件在內的保函背景資料，申請人加蓋公章的保函格式，近期經審計的財務報表，反擔保措施及相關證明文件等。
（2）銀行審核申請人資信情況、履約能力、項目可行性、保函條款、及其提交材料的完整性與合法性。
（3）落實反擔保措施
（4）簽訂《出具保函協議書》（中國建設銀行格式）
（5）對外開出保函。
整個流程比較復雜，從提交到出保函，大概得需要7-14天不等。
二、占用擔保公司在銀行的額度出保函
（1）提供的資料僅僅只有：招標文件電子版、營業執照電子版。
（2）擔保公司根據招標文件要求，做保函的格式，然后給申請企業確認。
（3）格式沒問題，交手續費（幾百塊）給到擔保公司。
（4）擔保公司提交銀行，等著出保函，快的話，當天就出保函，慢的話，隔天出保函。
農民工工資保證金保函，是指施工總承包單位在工程開工之前，按照工程合同價款的一定比例向銀行專戶存儲的工資專項資金的一種保證方式。該保函由銀行類金融機構出具，可以替代實際存儲的工資保證金，專項用于支付為所承包工程提供勞動的農民工被拖欠的工資。這種方式既保障了農民工的權益，也減輕了施工總承包單位的資金壓力。