黃曉軍教授主持國家863計劃、國家杰出青年基金、國家自然基金重點項目等國家項目，在白血病等惡性血液病的、診斷等方面進行了系統性和開創性工作，以或通訊作者身份在新英格蘭醫學雜志（New Eng J Med，2篇）、臨床腫瘤學（J Clin Oncol，1篇）、血液學（Blood，6篇）、白血病（Leukemia，5篇）等國際期刊發表SCI論文190篇，主編專著20部。牽頭制定多項中國及亞太血液病指南/標準并推廣普及，主持我國高水平多中心臨床研究，領導建設中國造血干細胞移植登記數據庫、慢性髓性白血病聯盟，促進我國血液病診治的規范化及人才建設。
黃曉軍，男，1964年生，漢族，江西省南豐縣人，北京大學人民醫院血液病研究所所長，主任醫師、教授。
1987年畢業于中山醫科大學醫療系。
1992年于北京醫科大學獲醫學博士學位。
1997年-1998年在美國Einstein醫學院腫瘤研究中心從事血液惡性腫瘤新的研究。
1989年開始從事血液病臨床及實驗研究，對造血干細胞移植技術及其各種合并癥、各種急慢性白血病的診斷有豐富的臨床經驗。率先探索并完成了人類白細胞抗原(HLA)不合/單倍體HSCT(hematopoieticstem cell transplantation)的臨床和實驗研究;在國內早成功開展了非血緣HSCT，創立并完善了非血緣HSCT的技術體系;領導了非清髓HSCT的臨床工作;對HSCT后復發白血病的傳統技術進行了改造。
是個感染指南的執筆者及制定者之一。
2007年擔任國家杰出青年科學基金項目負責人，創新團隊帶頭人。負責承擔國家自然科學基金國家“863”基金、“985”基金、北京大學211基金、衛生部基金、教育部博士點和“新世紀人才”等多項基金。發表論文100多篇，綜述10多篇，專著10部。1996年被評為碩士研究生導師，1999年獲北京市醫務工作者，2003年獲北京市五、四青年稱號，被評為博士生導師。2005年被評為教育部“新世紀人才”。在2006年獲中華醫學科技獎二等獎，2008年衛生部吳楊獎獲得者，2008年中國醫師獎獲得者。
“北京方案”白血病取得與同胞全合一致的療效。２０１６年，該方案被世界骨髓移植協會推薦作為全球缺乏全相合供體的移植可靠方案；該方案還被寫入國際骨髓移植教材，并被美國、英國等國骨髓移植相關指南引用。“北京方案”改變了全球造血干細胞移植的格局，近3年已成為我國來源類型的移植方式，也促進了歐美單倍體移植的快速發展，使造血干細胞移植進入“人人都有供者”的新時代. 主要貢獻如下： （1） 發展完善了國際原創的單倍體移植體系：突破免疫屏障，使造血干細胞移植這種白血病方法不再限于“配型相合”，“父母供子女，子女供父母”等“單倍體移植”模式取得與全合移植相同療效。此體系的發展與應用成功解決了“供者匱乏”這一困擾全世界的關鍵臨床問題，迎來了“人人都有移植供者”新時代。 （2）移植合并癥防治：建立了以分層乃至個體化為特色的移植后白血病復發及移植物抗宿主病新型防治體系，臨床上實現了抗白血病效應和移植物抗宿主作用分離，提高了患者生存。 （3）白血病分層與靶向：國際上首次證實口服砷劑可替代靜脈砷劑急性早幼粒細胞白血病（APL），在此基礎上證實非高危APL患者口服砷劑聯合維甲酸即可獲長期生存，首次實現了不輸液、不化療白血病可行性；還發現APL砷劑耐藥時新的“突變熱點區”。