黃曉軍于1987年畢業于中山醫科大學醫療系；1992年獲得北京醫科大學獲醫學博士學位；1997—1998年在美國阿爾伯特·愛因斯坦醫學院腫瘤研究中心從事血液惡性腫瘤新的研究；2005年任北京大學血液病研究所所長 ；2007年獲得“國家杰出青年科學基金”資助；2012年入選“科技北京百名領軍人才”；2013年入選“國家百千萬人才工程”；2017年3月入選“中國十大醫學新聞人物”；2022年當選為中國醫學科學院學部委員；2023年當選法國國家醫學科學院外籍通訊院士；2023年11月，當選為中國工程院院士。
黃曉軍教授主持國家863計劃、國家杰出青年基金、國家自然基金重點項目等國家項目，在白血病等惡性血液病的、診斷等方面進行了系統性和開創性工作，以或通訊作者身份在新英格蘭醫學雜志（New Eng J Med，2篇）、臨床腫瘤學（J Clin Oncol，1篇）、血液學（Blood，6篇）、白血病（Leukemia，5篇）等國際期刊發表SCI論文190篇，主編專著20部。牽頭制定多項中國及亞太血液病指南/標準并推廣普及，主持我國高水平多中心臨床研究，領導建設中國造血干細胞移植登記數據庫、慢性髓性白血病聯盟，促進我國血液病診治的規范化及人才建設。
“北京方案”改變了全球造血干細胞移植的格局，近3年已成為我國來源類型的移植方式，也促進了歐美單倍體移植的快速發展，使造血干細胞移植進入“人人都有供者”的新時代. 主要貢獻如下： （1） 發展完善了國際原創的單倍體移植體系：突破免疫屏障，使造血干細胞移植這種白血病方法不再限于“配型相合”，“父母供子女，子女供父母”等“單倍體移植”模式取得與全合移植相同療效。此體系的發展與應用成功解決了“供者匱乏”這一困擾全世界的關鍵臨床問題，迎來了“人人都有移植供者”新時代。 （2）移植合并癥防治：建立了以分層乃至個體化為特色的移植后白血病復發及移植物抗宿主病新型防治體系，臨床上實現了抗白血病效應和移植物抗宿主作用分離，提高了患者生存。 （3）白血病分層與靶向：國際上首次證實口服砷劑可替代靜脈砷劑急性早幼粒細胞白血病（APL），在此基礎上證實非高危APL患者口服砷劑聯合維甲酸即可獲長期生存，首次實現了不輸液、不化
北京大學人民醫院血液科黃曉軍專家門診在線咨詢。黃曉軍，北北京大學人民醫院，血液病研究所主任醫師，教授，博士生導師，醫學博士。臨床擅長于血液系統疾病，造血干細胞移植后的移植物抗宿主病、感染和復發等各種移植合并癥的診斷和處理，如白血病、地中海貧血、骨髓移植等疾病。主持國家863計劃、國家杰出青年基金、國家自然基金重點項目等多項國家課題，以通訊或作者發表SCI論文270余篇，入選2014、2015年中國高被引學者榜單，獲國家科技進步二等獎1項、省部級一等獎4項、吳階平醫藥創新獎。