關稅保函（Guarantee for the Customs Duties）是指擔保銀行應進口商（含加工貿易企業）的申請而向海關出具的、保證進口商履行繳納關稅義務的書面文件。關稅保函主要包括兩種類型，即關稅保付保函、加工貿易稅款保付保函。
保函的有效期通常從開立之日起到工程合同預計竣工日期延長3個月為止。如果工程未按時完工，申請人在保函到期前需要辦理延期手續。當工程項目出現拖欠農民工工資的情況時，由人社部門和行業主管部門共同出具書面通知，啟動保函賠付程序。金融機構需要在收到通知后的3個工作日內劃撥資金至指定的賬戶，用于支付拖欠的工資。
商業保函指的是，除了銀行以外，由其他商業機構出具的保函，一般出具保函的公司都是專業的擔保機構或商業機構的信用擔保。商業保函也是包括了很多種的，比如預付款保、農民工工資支付保函、質量保函、投標保函、履約保函等，這些都是屬于商業保函。
預付款保函（advance payment guarantee）承包人要求銀行向業主(發包人) 出具的保證業主所支付的工程預付款用于實施項目的一種信用函件。投標人在中標后簽訂的合同中規定，承包人委托銀行向業主出具的由業主按合同規定向承包人支付一筆工程預付款，及時用于實施項目的保證函件（即A委托B向C作出擔保，擔保內容是C按合同約定向A支付的預付款確實在用于項目的實施）。擔保銀行應為業主所接受。如承包人不履約，業主可憑保函向擔保銀行索賠。