共同點：
無論注冊在公司名下還是個人名下，審查流程及時間都是相同的，當前審查期限約4個月左右，符合《商標法》規定的予以初步審定，反之就予以駁回。
商標注冊成功后所享有的權利也都是相同的，10年到期后，若繼續使用都需向商標局申請續展，期間若遇到商標撤銷三年不使用或無效宣告，都需要依法答辯，否則有可能就無效了。
不同點：
1、資料不同
推定委托代理機構提交為例
個人：身份證+個體執照+委托書+標樣；身份證、個體執照、委托書都需申請人簽字。
公司：營業執照+委托書+標樣；營業執照、委托書需加蓋公章
2、穩定性不同
若以公司名義申請，則公司變更地址、名義后，商標也需要同步變更。尤其是公司被注銷后，商標轉讓或移轉要求較為嚴格。
而以個人名義申請的，眾所周知身份證一般情況下，自然人生前很少變更，相對于公司申請來說較為穩定。
3、財產屬性不同
若注冊在個人名下，屬于個人財產，若發生意外，繼承人可以依法繼承；
若注冊在公司名下，屬于公司資產，公司在注銷前，需要把商標轉讓給其他組織或自然人名下，一旦注銷后辦理移轉需要有確定的承繼文件。
企業：
①企業地址名稱任何信息出現變動，商標都要申請變更；
②公司注銷，商標也不存在了；
③商標使用證據容易取證；
個人：
①個人申請需要辦理個體工商戶營業執照；
②商標在個人名下會有財產權的問題；
③個人商標可以許可給企業使用；
④個人商標的使用證據不易取證，容易被“撤三”；
⑤商標申請時，注冊范圍必須和個體工商執照上的業務相關。
所以，個體工商戶或個人獨資企業更適合以個人名義申請注冊商標，而多股東的企業，就更適合以公司的名義申請注冊商標。
無論是以個人名義申請還是企業名義申請，費用都是相同的。
《商標法》規定：許可人應當監督被許可人使用其注冊商標的商品質量。
被許可人應當保證使用該注冊商標商品的質量。經許可使用他人注冊商標的，必須在使用該注冊商標的商品上標明被許可人的名稱和商品產地。