根據水垢的化學組成成分,蒸發器冷凝系統水垢的清洗方法采用化學酸洗法,即利用無機酸或有機酸與水垢發生化學反應,使其從被清洗表面轉化、脫離、溶解。由于酸性清洗介質尤其是強酸具有腐蝕性,因此應采取***緩蝕防范措施,并慎重選擇清洗劑和清洗工藝。由于換熱設備上形成的水垢以碳酸鈣(鎂)為主,易溶于強酸生成強酸鹽并釋放出二氧化碳；脫臭塔少量難溶的硫酸鹽、磷酸鹽、硅酸鹽水垢,會隨著大量碳酸鹽水垢的溶解而變成松散的垢渣自動脫落或被液體沖掉。
因此,對于碳鋼換熱設備,使用鹽酸清洗碳酸鹽水垢,濃度一般控制在5%～8%。對于鋁合金換熱設備,由于鋁不耐無機酸腐蝕,工業上多用有機酸清洗。由于氨基磺酸的多數金屬鹽在水中的溶解度較高,并且氨基磺酸與鈣鎂碳酸鹽垢反應劇烈并產生二氧化碳氣體,同時對金屬腐蝕性小,因此常被用來清洗銅、鋁等材料制造的設備表面上的水垢,一般控制濃度在7%～10%,清洗時一定要控制溫度不能超過60℃。