主要是恢復操作系統、文件系統層的數據。這種丟失主要是軟件邏輯故障、病毒木馬、誤操作等造成的數據丟失，物理介質沒有發生實質性的損壞，一般來說這種情況下是可以修復的，一些專用的數據恢復軟件都具備這種能力，如winhex，rstudio等。在所有的軟損壞中，系統服務區出錯屬于比較復雜的，因為即使同一廠家生產的同一型號硬盤，系統服務區也不一定相同，而且廠家一般不會公布自己產品的系統服務區內容和讀取的指令代碼。
硬件故障數據恢復 硬件故障占所有數據意外故障一半以上，常有雷擊、高壓、高溫等造成的電路故障，高溫、振動碰撞等造成的機械故障，高溫、振動碰撞、存儲介質老化造成的物理壞磁道扇區故障，當然還有意外丟失損壞的固件BIOS信息等。
提防用戶錯誤 雖然我們不愿意承認，但是很多時候是因為我們自己的問題而導致數據丟失。可以考慮利用文字處理器中的保障措施，例如版本特征功能和跟蹤變化。用戶數據丟失的常見的情況就是當他們在編輯文件的時候，意外地刪除掉某些部分，那么在文件保存后，被刪除的部分就丟失了，除非你啟用了保存文件變化的功能。如果你覺得那些功能很麻煩，那么我建議你在開始編輯文件之前將文件另存為不同名稱的文件，這個辦法不像其他辦法一樣組織化，不過這確實是一個好辦法，也能夠解決數據丟失的問題。
另外一個成本相對較低的解決方法就是在你的電腦上安裝第二個硬盤，當操作系統被破壞時，第二個硬盤驅動器不會受到任何影響，如果你還需要購買一臺新電腦時，這個硬盤還可以被安裝在新電腦上，而且這種硬盤安裝非常簡便。如果你對安裝第二個驅動盤的方法不很認可，另一個很好的選擇就是購買一個外接式硬盤，外接式硬盤操作更加簡便，可以在任何時候用于任何電腦，而只需要將它插入USB端口或者firewire端口。
