醫藥潔凈工程中潔凈室這個概念一開始就是因為手術室才存在的，在沒有潔凈室的年代據大數據統計每年都有約10%的病患因感染而喪命。外科手術中病患的傷口更是直接暴露在空氣中，所以感染率更高?？諝鉂崈艏夹g用在手術室工程中可以創造出一個無菌環境，將正在進行手術的醫生和病患以及手術器械都籠罩在內，極大地降低了感染率。
醫藥潔凈工程中潔凈室這個概念一開始就是因為手術室才存在的，在沒有潔凈室的年代據大數據統計每年都有約10%的病患因感染而喪命。外科手術中病患的傷口更是直接暴露在空氣中，所以感染率更高?？諝鉂崈艏夹g用在手術室工程中可以創造出一個無菌環境，將正在進行手術的醫生和病患以及手術器械都籠罩在內，極大地降低了感染率。
醫藥潔凈工程中生產區域要求潔凈車間內應保持適當的新鮮空氣，保證室內工作人員每人每小時都有不少于40m的新鮮空氣。溫度和濕度的要求與潔凈車間的潔凈度息息相關，通常潔凈度為100級和10000級的潔凈車間要求溫度為20~24℃、濕度為45~60%；潔凈度為100000級的潔凈車間要求溫度為18~28℃、濕度為50~65%。
醫藥潔凈工程中潔凈車間還要求提供足夠的照明，主要工作區域照明亮度值應高于300lux。無塵廠房的走廊和次要工作區域照明亮度值應在150～300lux之間。
醫藥潔凈工程之無塵廠房的設計既要滿足現階段產品的生產的基本需求，又要考慮到后續生產拓展和技術改進的可能性。潔凈車間的指標也是醫藥生產性的重要指標，切不可大意。
醫藥潔凈工程的工藝布置應防止人與物流之間的混合交叉污染。首先，要將人員和其它物品進出生產區域的通道分開設置，比較容易被污染的材料（如一些原材料和輔助材料，生產中產生的廢渣等）可以設置專門特殊入口。為加快生產效率，潔凈車間之間的貨物路線的布置要盡可能短。醫藥潔凈工程布局的生產作業區間內只應安置必要的工藝設備， 用作生產和儲存的區域不得用作該區域以外工作人員的出入道路。運輸人或者物品的電梯應分開，且不可設置在潔凈車間內。
