醫藥潔凈工程史上的初個潔凈室建于1966年在美國，當時已有實驗證明，一定量的空氣微粒進入到人體血液中會引發一系列的并發癥，所以該潔凈室主要用于醫院的外科手術室工程。手術環境解決后，人們又把目光轉移到制藥工程上，因為含有的一旦進入人體，也會引起人體的病變反應，所以制藥潔凈室工程的建立也被劃入了醫學研究范圍。
醫藥潔凈工程中潔凈室這個概念一開始就是因為手術室才存在的，在沒有潔凈室的年代據大數據統計每年都有約10%的病患因感染而喪命。外科手術中病患的傷口更是直接暴露在空氣中，所以感染率更高。空氣潔凈技術用在手術室工程中可以創造出一個無菌環境，將正在進行手術的醫生和病患以及手術器械都籠罩在內，極大地降低了感染率。
其二，圍手術期護理技巧：圍手術期的護理工作是整個手術室護理中的核心內容。涉及到術前、術中、術后的護理干預。
手術室工程加上護理會大大提高手術成功率。手術室的細節護理有很多，護理人員要根據手術患者的病情不同癥狀不同有不同的護理方式。護理人員要有無菌觀念，雖然君信達進行了凈化工程涉及，但醫護人員自身的觀念和意識也相當重要。
隨著科技的發展，手術室各項指標都會被儀器檢測并顯示在電腦上，我們可以根據相關的提示予以積極的調整。君信達的手術室工程包括了對醫護人員的培訓，也提供了一些常用的工具，確保了清潔室工程的效果。
醫藥潔凈工程的工藝布置應防止人與物流之間的混合交叉污染。首先，要將人員和其它物品進出生產區域的通道分開設置，比較容易被污染的材料（如一些原材料和輔助材料，生產中產生的廢渣等）可以設置專門特殊入口。為加快生產效率，潔凈車間之間的貨物路線的布置要盡可能短。醫藥潔凈工程布局的生產作業區間內只應安置必要的工藝設備， 用作生產和儲存的區域不得用作該區域以外工作人員的出入道路。運輸人或者物品的電梯應分開，且不可設置在潔凈車間內。
