在無菌車間中，使空間內達到無菌要求，就是室內環境控制的重點。控制微生物的生長、殺滅或去除微生物的方法通常有兩種，一種為化學類，另一種為物理類。其中，化學方法有化學劑、氣化雙氧水、臭氧和環氧乙烷等;物理方法有濕熱或干熱、輻射和過濾等。
無塵無菌車間是車間既能達到無塵效果，又能達到無菌效果的一種新有名詞。它是污染控制的源頭。在工廠里，沒有無塵室，污染敏感度高的零件不可能批量生產。無塵無菌車間被定義為具備空氣過濾、優化、構造材料和組裝的房間，其中特定的規定操作程序是控制空氣懸浮微粒濃度，從而達到其規定的標準。
食品無塵無菌包裝是指將經過后已獲得商業無塵無菌狀態的產品，封閉在已的容器中，在無塵無菌環境下灌注，灌裝后包裝容器保持密封以防止再度感染，以期在不加防腐劑、不經冷藏條件下得到較長的貨架壽命的包裝方法。
食品物料的分為熱力和冷菌。食品無塵無塵無菌包裝的物料到目前為止主要是熱力，其又分超高溫和高溫短時兩種，物料的冷方法 主要指紫外線和微波。超高溫是指在溫度和時間分別為135-150℃和2-8秒的條件下，對乳品或其他食品進行處理的一種工藝。由于它具有許多優 點，特別是可以解決既能殺死產品中的微生物，又可較好的保持食品品質與營養價值這對矛盾，現已廣泛應用于牛乳、果汁及果汁飲料、豆乳、茶、酒、礦泉水及其 它產品的生產。
