在無菌室的設計中，通過向室內輸送定量的潔凈空氣，稀釋置換室內已使用過的潔凈空氣，將臟空氣排出室外，使室內的空氣潔凈度等級達到100000級、10000級或局部達到100級的空氣潔凈度要求，室內已使用過的臟空氣由清潔的空氣取代，在空氣的稀釋置換設計中，臟空氣與清潔空氣持續地混合稀釋，逐漸減少房間中的微粒負荷。
置換稀釋設計對潔凈區域的空氣凈化系統的設計有很高的要求，而且必須考慮無菌室的布局和操作方式，還要為關鍵區間提供合適的局部單向空氣流動保護，需要注意與空氣凈化系統供應的空氣一樣，滿布空氣過濾器的單向流動罩產生的空氣流動也可以置換稀釋房間中空氣傳播的微粒，這種空氣流動會增加有效的房間空氣交換率，并有助于污染空氣置換稀釋。
無菌室前，應將所有物品置于操作之部位（待檢物例外），然后打開紫外燈30分鐘，時間一到，關閉紫外燈待用 進入無菌室前，必須于緩沖間更換過的工作服、工作帽及工作鞋。 操作應嚴格按照無菌操作規定進行，操作中少說話，不喧嘩，以保持環境的無菌狀態。 吸取菌液時，必須用吸耳球吸取，切勿直接用口接觸吸管，如吸管碰到手及其它未的物體，必須重 新 更 換 ，以 防污染 。
定期檢查室內空氣無菌狀況，數應控制在10個以下，發現不符合要求時，應立即徹底。/無菌室無菌程度的測定方法：取普通肉湯瓊脂平板、改良馬丁培養基平板各3個（平板直徑均9厘米），置無菌室各工作位置上，開蓋曝露半小時，然后倒置進行培養，測總數應置37℃溫箱培養48小時；測霉菌數則應置27℃溫箱培養5天。`霉菌總數均不得超過10個為 。
