無菌室空氣凈化工程是屬于生物凈化工程的一種，一般無菌室要求的潔凈度為萬級，標準的微生物檢測實驗室都會專門開辟5~8個平方出來建造無菌室，無菌室只要夠放置實驗室樣品及必需的設備即可，面積無需過大而造成浪費，面積過大對于做無菌室空氣凈化工程來說不僅僅是提高建造成本而已，日后的運行及維護費用也會高的令人驚訝。一般微生物檢測按照實驗室行業要求都需要在無菌室中進行，很多食品菌、微生物等都是在超凈工作臺中完成檢測和化驗的。
無菌室內配置了百級超凈工作臺也并不是所有都可以進行實驗的，一般常規的菌落總數、微生物培養、血細胞培養、研究、干細胞研究、大腸菌等實驗可以在百級超凈臺進行。但是如果需要做致病，為了達到保護實驗室人員的問題，就必須得建造生物實驗室，使用生物柜進行實驗。該類實驗不能在普通的無菌實驗室中進行。
無菌室內空氣置換稀釋污染系統設計時應注意：潔凈空氣供應的體積應足以抵消空間中不斷產生的微粒數，以此維持工藝操作的基本條件要求；室內空間供應的空氣應比普通維持條件下空氣更清潔；要求混合供應的清潔空氣應滿足去除房間內含有微粒的空氣，以達到室內空氣置換稀釋的作用。
準備工作 1． 先進行無菌室空間的，開啟紫外燈30—60分鐘 2． 檢驗用的有關器材， 搬入無菌室前必須分別進會 3． 操作人員必須將手清洗，穿戴好無菌工作衣、帽和鞋，才能進入無菌室 4． 進入無菌室后再一次手部，然后才進行檢驗操作
