制藥廠潔凈室工程設計注重節能、環保和消防措施。環境工程貫徹于主體工程同時設計、同時施工、同時投產的“三同時”原則。而項目設計不僅要滿足項目實施的需要，還要同時為企業的未來發展留有余地。
具體而言，潔凈空調系統通常按不同的功能區設計，基本各功能區獨立空調，是工程部運行維護的重點，也通過充分的驗證及BMS/EMS監控來保障。
純化水系統中是否一定要配置EDI也可根據生產需求。此外，壓縮空氣分配系統0.22μm的過濾器的安裝位置，分析結果可為動力房等非潔凈區用點，該類用點無需經過過濾。
微生物檢測方法有空氣懸浮微生物法和沉降微生物法兩種，采樣后的基片（或平皿）經過恒溫箱內３７℃、４８h的培養生成菌落后進行計數。使用的采樣器皿和培養液必須進行處理。采樣點可均勻布置或取代代表性地域布置。
風量罩罩體與風口尺寸相差較大時會造成較大的測量誤差，所以需要用尺寸相近的罩體進行測量。根據待測風口的尺寸、面積，選擇與風口的面積較接近的風量罩罩體，且罩體的長邊長度不得超過風口的長邊長度的3倍；風口的面積不應小于罩體邊界面積的15%，選擇合適的罩體后，打開測量儀表，檢查儀表正常，使儀表的各項設定滿足使用要求；確定罩體的擺放位置來罩住風口，風口宜位于罩體的中間位置；保證無漏風，觀察儀表的顯示值，待顯示值趨于穩定后，讀取風量值，當風口風量較大時，風量罩罩體和測量部分的節流對風口的阻力會增加造成風量下降較多，為了消除這部分的風口風量較少，需要進行背壓補償。依據讀取的風量值，考慮是否需要進行背壓補償，當風量值≤1500m3/h時，無需進行背壓補償，所讀風量值即為所測風口的風量值；當風量值>1500 m3/h時，使用背壓補償擋板進行背壓補償，讀取儀表顯示值即為所測的風口補償后風量值。
背壓補償模式測試：為了使測得風量值更接近于風量的真實值，減小由于風量罩對系統造成壓損而產生的測試誤差。建議在風量大于1500 m/h時采用背壓補償模式測試,
1）當測試模式為“B.Press”時，按下“START”鍵儀器開始測量，風量穩定后測試自動停止。
2）界面提示“打開背壓板”，手動把背壓板打開后，按下“START”鍵，儀器開始測試。
3）測試結束后儀器自動停止，顯示經過背壓補償后的風量值。
4）若對停止時的風量進行保存，可以按“SAVE”鍵將本次測得風量值保存，“Cycle”自動加1。