潔凈室懸浮微生物法應采用離心式、狹逢式和針孔式等碰擊式采樣器，采樣時間應根據空氣中微生物濃度來決定，采樣點數可與測定空氣潔凈度測點數相同。各種采樣器應按儀器說明書規定的方法使用。沉降微生物法，應采用直徑９０mm培養皿，在采樣點上沉降３０mm后進行采樣，培養皿最少采樣數應符合表Ｂ.５.２的規定。
用培養皿沉降菌，用碰撞式采樣器或過濾采樣器測定游浮菌，還應遵守以下規定：
１、采樣裝置采樣前的準備及采樣后的處理，均應在設游空氣過濾器排風的負壓實驗室進行操作，該實驗室的溫度應為２２±２℃；相對濕度為５０％±１０％；
２、采樣儀器應；
３、采樣器選擇應審核其精度和效率，并有合格證書；
４、采樣裝置的排氣不應污染潔凈室；
５、沉降皿個數及采樣點、培養基及培養溫度、培養時間應按有關規范的規定執行；
６、潔凈室浮游菌采樣器的采樣率宜大于１００Ｌ／min；
７、碰撞培養基的空氣速度應小于２０m/s。
風量罩罩體與風口尺寸相差較大時會造成較大的測量誤差，所以需要用尺寸相近的罩體進行測量。根據待測風口的尺寸、面積，選擇與風口的面積較接近的風量罩罩體，且罩體的長邊長度不得超過風口的長邊長度的3倍；風口的面積不應小于罩體邊界面積的15%，選擇合適的罩體后，打開測量儀表，檢查儀表正常，使儀表的各項設定滿足使用要求；確定罩體的擺放位置來罩住風口，風口宜位于罩體的中間位置；保證無漏風，觀察儀表的顯示值，待顯示值趨于穩定后，讀取風量值，當風口風量較大時，風量罩罩體和測量部分的節流對風口的阻力會增加造成風量下降較多，為了消除這部分的風口風量較少，需要進行背壓補償。依據讀取的風量值，考慮是否需要進行背壓補償，當風量值≤1500m3/h時，無需進行背壓補償，所讀風量值即為所測風口的風量值；當風量值>1500 m3/h時，使用背壓補償擋板進行背壓補償，讀取儀表顯示值即為所測的風口補償后風量值。
我們進行無塵車間氣流流型(單向流)的檢測,明確無塵車間內的設備或設施對氣流的影響,選擇或改善氣流流型使之產生最小的湍流(渦流)，增加無塵車間的自凈能力或恢復率，縮短自凈時間。在紊流潔凈室中，風的輸送和混合都是紊流方式進行的。為確保污染物被清楚，無塵車間的各個部分必須均實現良好的空氣混合。
氣流流形的檢測應按以下步驟進行：
1：布置測點：1)垂直單向流無塵車間選擇縱、橫剖面各一個，以及距地面高度0.8m、1.5m的水平面各一個;水平單向流無塵車間選擇縱剖面和工作區高度水平面各一個，以及距送、回風墻面0.5和房間中心處等3個橫剖面，所有面上的測點間距均為0.2m~1m；2)亂流無塵車間選擇通過代表性送風口中心的縱、橫剖面和工作區高度的水平面各一個，剖面上的測點間距為0.2m~0.5m，水平面上測點間距為0.5m~1m。兩個風口之間的中線上應有測點。
2：測定方法：用發煙器或懸掛單絲線的方法逐點觀察和記錄氣流流向，并可用量角器量出角度，發煙源可用超聲波霧化(0.5um~50um水霧)的去離子(DI)水、噴射方法生成的乙醇或二醇、固態二氧化碳(干冰)等，在高強度光源下示蹤。在確保對人和物無傷害時可以四氯化鈦(TiCl4)作示蹤粒子。