制藥廠潔凈室工程設計注重節能、環保和消防措施。環境工程貫徹于主體工程同時設計、同時施工、同時投產的“三同時”原則。而項目設計不僅要滿足項目實施的需要，還要同時為企業的未來發展留有余地。
具體而言，潔凈空調系統通常按不同的功能區設計，基本各功能區獨立空調，是工程部運行維護的重點，也通過充分的驗證及BMS/EMS監控來保障。
純化水系統中是否一定要配置EDI也可根據生產需求。此外，壓縮空氣分配系統0.22μm的過濾器的安裝位置，分析結果可為動力房等非潔凈區用點，該類用點無需經過過濾。
許多行業的生產環境要求必須是無塵車間，許多客戶在無塵車間建設完工之后，并不了解如何才能判斷無塵車間是否達標，是否滿足自己企業的生產需求，那么在對無塵車間進行測試時都需要通過哪幾項的測試呢？根據IES－RP－CC006．2無塵車間測試的標準，無塵車間的工作狀態分為空態、靜態和動態三種，測試方式取決于無塵車間設計的類型和無塵車間所處的工作狀態。
在無塵車間的建造合同中通常只指定了最基本的空態測試，而靜態和動態測試常常因為緊張的工期而被遺漏。但我們仍建議承建商和業主在靜態和動態條件下都對無塵車間進行測試。這將確保無塵車間的建造符合設計要求。靜態和動態兩種不同條件下測試結果的對比將對分析無塵車間所存在的問題提供很有效的幫助。例如：在靜態條件下潔凈度達標而到了動態條件下卻超標。這可能是因為糟糕的無塵車間管理：安裝機器時不規范的清潔，不恰當的清潔程序，不嚴格的紀律管理，不正確的機器放置位置（擋住了回風口或阻斷了過濾器的送風）等。因此，我們建議在空態和動態時都要對無塵車間進行測試。
大多數的驗收標準是由無塵車間的業主和承建商通過協商，并參考專業無塵車間測試認證公司的建議而達成的協議。由于獨立的第三方測試認證公司通常能對于無塵車間的測試提出適合的方案，因此中建南方建議業主和承建商在開始討論無塵車間的各種技術參數，測試方式和驗收標準時就邀請測試認證公司參與。在對有關參數或標準產生分歧時，測試認證公司將以自己的專業知識在業主和承建商之間起到調解人的作用。