生物藥廠工程設計也要包括以下幾個方面。
，工廠總圖設計。在廠址確定之后，涉及廠區各區域的劃分和布局、車間和其他設施的組成和布局、運輸系統的布局，廠區管線(物料、水、電汽、氣等)的布局、綠化布局、遠期發展、布局規劃等。
第二，潔凈室空調工藝設計。涉及工藝流程、設備選購、生產能力估算、勞動定員和生產班制、車間水、電汽(氣)、冷公用工程量的估算、管道計算和設計、設計說明書的編寫、概預算的編寫、此外還要對其他專業提出要求。
第三，其他設計。采暖通風、供熱、供電(照明和動力)、供汽(氣)、弱電、火災報警、自控儀表、工程經濟、總圖運輸、管道等。
許多行業的生產環境要求必須是無塵車間，許多客戶在無塵車間建設完工之后，并不了解如何才能判斷無塵車間是否達標，是否滿足自己企業的生產需求，那么在對無塵車間進行測試時都需要通過哪幾項的測試呢？根據IES－RP－CC006．2無塵車間測試的標準，無塵車間的工作狀態分為空態、靜態和動態三種，測試方式取決于無塵車間設計的類型和無塵車間所處的工作狀態。
無塵車間風量調試
這個調試主要是根據設計施工圖紙來計算的，可以計算出無塵車間建設時的設計風量。對新建無塵車間潔凈度進行測試時，主要分為以下三種狀態：空態條件、靜態條件、動態條件。建設完無塵車間成以后，企業可以從這三個條件下分別對無塵車間的潔凈度進行測試，重點關注每種狀態下的潔凈度是否達到企業所要求的標準。
在無塵車間的建造合同中通常只指定了最基本的空態測試，而靜態和動態測試常常因為緊張的工期而被遺漏。但我們仍建議承建商和業主在靜態和動態條件下都對無塵車間進行測試。這將確保無塵車間的建造符合設計要求。靜態和動態兩種不同條件下測試結果的對比將對分析無塵車間所存在的問題提供很有效的幫助。例如：在靜態條件下潔凈度達標而到了動態條件下卻超標。這可能是因為糟糕的無塵車間管理：安裝機器時不規范的清潔，不恰當的清潔程序，不嚴格的紀律管理，不正確的機器放置位置（擋住了回風口或阻斷了過濾器的送風）等。因此，我們建議在空態和動態時都要對無塵車間進行測試。