電子廠凈化車間有較大的特點就是潔污分流，人員和物品都是專用通道，避免產生交叉污染。除此之后還要經過風淋室進行吹淋，將附著在人員、物品的污染物排除掉，避免將污染物帶到潔凈區，影響凈化車間的凈化效果。
電子廠凈化車間管理和普通車間管理上面的區別有：
1、根據環境潔凈程度，定期更換初、中效空氣過濾器，中效過濾器更換時間隔一般為3-6個月，新風進口的初效過濾器更換清洗時間間隔為30天左右。
2、定期(3~6個月)檢測各潔凈室的壓力，一般潔凈區正壓應大于10pa，否則必須檢查初效、中效過濾器是否堵塞，更換、檢查送排風機是否運轉正常。
3、定期(一般為3~6個月)用塵埃粒子計數器測定潔凈室的潔凈度，如不符合技術參數可調節送、回風管上的可調風閥來調節送風量和控制回風量，直至室內潔凈度達到其技術參數為止。
4、一般為1年左右，就需要更換空氣過濾器，更換空氣過濾器時可將送風口上的散流風板取下，便可取下過濾器。更換時，應注意空氣過濾器上的箭頭方向(指向氣流方向)向下。
電子廠凈化車間在空氣過濾方式、送風量、氣壓、人員與物品進出管理等方面都比普通車間要嚴格很多。取代普通的生產車間是我國凈化車間進步的體現。