不同產地的冬蟲夏草差異是比較大的。西藏那曲、昌都蟲草和青海玉樹、果洛蟲草的品質是的，價格也最貴。因此，很多不法商家經常以其他產地的蟲草來冒充青藏兩個地區的蟲草，以次充好來銷售。這兩個產地的蟲草相比其他產地有以下特點：
那曲冬蟲夏草顏色略黃于玉樹冬蟲夏草。西藏那曲蟲草蟲體表面色澤最為黃凈，玉樹冬蟲夏草相對來說呈黃褐色。其他產地蟲草色或淡，或泛紅而灰白。另外，西藏那曲所產蟲草眼睛顏色為棕色，青海玉樹和果洛所產蟲草眼睛顏色為黃色，川草和其它地區所產的草多為紅色或深褐色。
相同大小的蟲草那曲的要輕點，因此，同一規格蟲草的玉樹蟲草看起來更緊實，那曲蟲草會顯得蟲體更肥大一些。
西藏那曲蟲草蟲體和尾皆透亮油潤，有股濃酥油的香味，青海蟲草氣味有一種濃郁的類香菇味，其他產地蟲草的香味則極淡。
四川阿壩、甘孜等地也出產冬蟲夏草。其產品質量遜于青海、西藏產的冬蟲夏草。總體來說，四川產冬蟲夏草肉質偏硬，色澤較深，味道苦，蟲草的眼睛為深褐色。根據古代文獻來看，《本草重新》紀錄古四川嘉定府所產蟲草。當然這也可能是古人能到的地域限制造成的。